Laboratorij je ovlašten za ispitivanje otpadnih voda od Državne uprave za vode prema objavi popisa ovlaštenih laboratorija (NN 107/00) i Rješenju Ministarstva poljoprivrede, šumarstva i vodnoga gospodarstva.
Pruža usluge analize vode prema vodopravnim dozvolama kao i njihovo ishodovanje.

Ispituju se sljedeći parametri:

- temperatura recipijenta i efluenta
- pH
- kemijska potrošnja kisika
- ukupna suspendirana tvar sušena
- ukupni fosfor
- ortofosfati
- ukupni dušik
- amonijak
- nitrati
- nitriti
- kloridi
- ukupni koliformi
- fekalni koliformi

Pokazatelji za koje laboratorij nije ovlašten ispituju se u Zavodu za javno zdravstvo Splitsko-dalmatinske županije.